Phòng điều hành Trung tâm hệ thống quan trắc tự động được đặt tại trụ sở của Trung tâm Quan trắc Tài nguyên và Môi trường - 173 đường Phạm Văn Đồng - TP Huế.

       Các dữ liệu đầu vào của Phòng điều hành Trung tâm được kết nối trực tiếp từ điểm xả thải của Trạm xử lý nước thải tập trung KCN Phú Bài đến Trung tâm Quan trắc Tài nguyên và Môi trường với mục đích kiểm soát chất lượng nước thải sau xử lý của cơ sở này.

       Hiện tại hệ thống quan trắc tự động, liên tục tại Trạm xử lý nước thải tập trung KCN Phú Bài có khả năng quan trắc tự động, liên tục với 6 thông số môi trường nước thải phù hợp theo quy định của Thông tư 35/2015/TT-BTNMT gồm: Nhiệt độ, pH,  Độ màu, Lưu lượng, TSS, COD.

       Trạm xử lý nước thải tập trung KCN Phú Bài hoạt động quan trắc tự động, liên tục 24/24h và truyền dữ liệu về phòng điều hành Trung tâm theo tần suất 5 phút/lần. Hệ thống thu thập được bộ dữ liệu quan trắc tự động, trích xuất dữ liệu theo hình thức bảng biểu, biểu đồ; quản lý, hiển thị dữ liệu (tên trạm, thông số, kết quả đo, đơn vị đo, thời gian, kết quả đo không đạt giá trị giới hạn quy định tại QCVN); tính toán và biên tập dữ liệu (tính toán giá trị lớn nhất, nhỏ nhất, giá trị trung bình, so sánh kết quả với QCVN).

       Phòng điều hành Trung tâm có nhiệm vụ cung cấp thông tin chính xác, kịp thời và có cảnh báo sớm về ô nhiễm môi trường, cho phép đánh giá được mức độ ô nhiễm các thông số cơ bản về chất lượng nước thải sau xử lý. Đây sẽ là cơ sở phục vụ cho công tác quản lý nhà nước về môi trường dưới tác động của khu công nghiệp.